Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACHD1Q5VU97 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
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