Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXP7

KIAA1644, Uncharacterized protein KIAA1644, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1644Q3SXP7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KIAA1644Q3SXP7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KIAA1644Q3SXP7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms