Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMN1Q16637 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMN1Q16637 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms