Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2H3Q13889 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H3Q13889 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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