Protein–RNA interactions for Protein: Q13503

MED21, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED21Q13503 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED21Q13503 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED21Q13503 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED21Q13503 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED21Q13503 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED21Q13503 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED21Q13503 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED21Q13503 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED21Q13503 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED21Q13503 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED21Q13503 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED21Q13503 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED21Q13503 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED21Q13503 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED21Q13503 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED21Q13503 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED21Q13503 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED21Q13503 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED21Q13503 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED21Q13503 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED21Q13503 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED21Q13503 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MED21Q13503 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED21Q13503 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED21Q13503 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED21Q13503 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED21Q13503 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED21Q13503 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED21Q13503 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED21Q13503 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED21Q13503 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED21Q13503 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MED21Q13503 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED21Q13503 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED21Q13503 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED21Q13503 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED21Q13503 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED21Q13503 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED21Q13503 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED21Q13503 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED21Q13503 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED21Q13503 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED21Q13503 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED21Q13503 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED21Q13503 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED21Q13503 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED21Q13503 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED21Q13503 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED21Q13503 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED21Q13503 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED21Q13503 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED21Q13503 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED21Q13503 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED21Q13503 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED21Q13503 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED21Q13503 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED21Q13503 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED21Q13503 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED21Q13503 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED21Q13503 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED21Q13503 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED21Q13503 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED21Q13503 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED21Q13503 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED21Q13503 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED21Q13503 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED21Q13503 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED21Q13503 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED21Q13503 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED21Q13503 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED21Q13503 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED21Q13503 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED21Q13503 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED21Q13503 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED21Q13503 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED21Q13503 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED21Q13503 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED21Q13503 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED21Q13503 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED21Q13503 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED21Q13503 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MED21Q13503 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED21Q13503 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MED21Q13503 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED21Q13503 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED21Q13503 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED21Q13503 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED21Q13503 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED21Q13503 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED21Q13503 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED21Q13503 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED21Q13503 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED21Q13503 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED21Q13503 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED21Q13503 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED21Q13503 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED21Q13503 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED21Q13503 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED21Q13503 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED21Q13503 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms