Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 HNRNPH3-209ENST00000486854 635 ntTSL 23.81□□□□□ -1.89e-7■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.111e-8■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 HNRNPU-217ENST00000638952 5678 ntTSL 515.36■□□□□ 0.051e-17■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.131e-17■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 HNRNPU-209ENST00000476241 4844 ntTSL 513.57□□□□□ -0.241e-17■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.371e-17■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 HNRNPU-228ENST00000640306 2917 ntTSL 512.43□□□□□ -0.421e-17■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.551e-17■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 HNRNPU-214ENST00000638475 2698 ntTSL 511.55□□□□□ -0.561e-17■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 HNRNPU-229ENST00000640440 871 ntTSL 38.88□□□□□ -0.991e-17■□□□□ 9.1
SRSF9Q13242 ZBED1-205ENST00000515319 905 ntTSL 29.6□□□□□ -0.877e-7■□□□□ 9
SRSF9Q13242 SFSWAP-203ENST00000535236 5593 ntTSL 1 (best)15.81■□□□□ 0.122e-6■□□□□ 9
SRSF9Q13242 SFSWAP-207ENST00000538548 2636 ntTSL 514.27□□□□□ -0.132e-6■□□□□ 9
SRSF9Q13242 SFSWAP-204ENST00000535399 778 ntTSL 213.98□□□□□ -0.172e-6■□□□□ 9
SRSF9Q13242 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.652e-6■□□□□ 9
SRSF9Q13242 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.672e-6■□□□□ 9
SRSF9Q13242 SFSWAP-209ENST00000540469 3536 ntTSL 310.06□□□□□ -0.82e-6■□□□□ 9
SRSF9Q13242 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.026e-10■□□□□ 9
SRSF9Q13242 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.026e-10■□□□□ 9
SRSF9Q13242 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.026e-10■□□□□ 9
SRSF9Q13242 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.276e-10■□□□□ 9
SRSF9Q13242 MPC1-205ENST00000487218 918 ntTSL 54.77□□□□□ -1.656e-10■□□□□ 9
SRSF9Q13242 MPC1-204ENST00000475708 651 ntTSL 51.75□□□□□ -2.136e-10■□□□□ 9
SRSF9Q13242 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.886e-8■□□□□ 9
SRSF9Q13242 WDR43-205ENST00000446643 579 ntTSL 44.69□□□□□ -1.666e-8■□□□□ 9
SRSF9Q13242 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.292e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.292e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.358e-13■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 ORMDL1-206ENST00000458355 914 ntTSL 311.9□□□□□ -0.52e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.682e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 CUL7-201ENST00000265348 5254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.848e-13■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.922e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.932e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.942e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 EPB41L2-203ENST00000368128 4456 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.952e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 EPB41L2-232ENST00000628542 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.962e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 GTF3C2-204ENST00000423998 828 ntTSL 58.5□□□□□ -1.052e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 CUL7-202ENST00000478630 749 ntTSL 58.5□□□□□ -1.058e-13■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 GTF3C2-201ENST00000264720 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.062e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 EPB41L2-216ENST00000527411 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.092e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.12e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 GTF3C2-208ENST00000457748 557 ntTSL 57.94□□□□□ -1.142e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 EPB41L2-218ENST00000527659 2436 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.152e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 EPB41L2-224ENST00000530481 3914 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.172e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 EPB41L2-201ENST00000337057 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.212e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 EPB41L2-221ENST00000529208 3023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.232e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 EPB41L2-207ENST00000456097 1138 ntTSL 57.1□□□□□ -1.272e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 GTF3C2-202ENST00000359541 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.282e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 EPB41L2-233ENST00000639623 3395 ntTSL 55.27□□□□□ -1.572e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.612e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.622e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.552e-11■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 LAMB1-205ENST00000439976 703 ntTSL 510.08□□□□□ -0.82e-11■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 LAMB1-203ENST00000393560 2806 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.912e-11■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 LAMB1-202ENST00000393559 550 ntTSL 28.92□□□□□ -0.982e-11■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 CREBZF-206ENST00000528561 1099 ntTSL 512.18□□□□□ -0.462e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 CREBZF-205ENST00000527529 898 ntTSL 59.58□□□□□ -0.882e-8■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.174e-6■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.284e-6■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.764e-6■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.674e-6■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 NECAB3-217ENST00000606106 591 ntTSL 412.14□□□□□ -0.471e-6■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 DOT1L-204ENST00000457590 2907 ntTSL 512.1□□□□□ -0.471e-6■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 NECAB3-220ENST00000606699 1022 ntTSL 211.51□□□□□ -0.571e-6■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.591e-6■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 NECAB3-216ENST00000498353 597 ntTSL 310.9□□□□□ -0.661e-6■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 ITGA1-202ENST00000504086 1366 ntTSL 210.79□□□□□ -0.681e-6■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 NECAB3-214ENST00000493590 625 ntTSL 510.28□□□□□ -0.761e-6■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 PELO-202ENST00000506949 888 ntTSL 29.75□□□□□ -0.851e-6■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 PELO-201ENST00000274311 4349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.881e-6■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 PLCXD1-206ENST00000430923 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 29.5□□□□□ -0.891e-6■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 PLCXD1-209ENST00000447472 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 48.97□□□□□ -0.971e-6■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 PLCXD1-204ENST00000415337 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.74□□□□□ -1.011e-6■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.431e-6■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.248e-20■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 SLC22A31-205ENST00000603735 791 ntTSL 310.73□□□□□ -0.698e-20■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 SLC22A31-204ENST00000568161 651 ntTSL 39.06□□□□□ -0.968e-20■□□□□ 8.9
SRSF9Q13242 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.15e-10■□□□□ 8.8
SRSF9Q13242 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.684e-33■□□□□ 8.8
SRSF9Q13242 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.884e-33■□□□□ 8.8
SRSF9Q13242 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.37□□□□□ -1.714e-33■□□□□ 8.8
SRSF9Q13242 MYO18A-207ENST00000530254 6479 ntTSL 1 (best)11.45□□□□□ -0.582e-6■□□□□ 8.8
SRSF9Q13242 MYO18A-209ENST00000531253 7504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.842e-6■□□□□ 8.8
SRSF9Q13242 MYO18A-223ENST00000628822 7501 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.872e-6■□□□□ 8.8
SRSF9Q13242 MYO18A-202ENST00000527372 9992 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.872e-6■□□□□ 8.8
SRSF9Q13242 MYO18A-214ENST00000533112 7522 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.892e-6■□□□□ 8.8
SRSF9Q13242 TRAPPC12-216ENST00000469400 720 ntTSL 27.97□□□□□ -1.131e-7■□□□□ 8.8
SRSF9Q13242 FLNA-216ENST00000490936 5374 ntTSL 1 (best)13.67□□□□□ -0.225e-11■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.395e-11■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.525e-11■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 FLNA-206ENST00000420627 8225 ntTSL 511.62□□□□□ -0.555e-11■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.585e-11■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.635e-11■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 FLNA-215ENST00000474358 696 ntTSL 210.92□□□□□ -0.665e-11■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.695e-11■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.695e-11■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 FLNA-209ENST00000444578 843 ntTSL 310.45□□□□□ -0.745e-11■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 FLNA-217ENST00000498411 368 ntTSL 310.14□□□□□ -0.795e-11■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.168e-7■□□□□ 8.7
SRSF9Q13242 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.158e-7■□□□□ 8.7
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