Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB15P59190 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB15P59190 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB15P59190 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB15P59190 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB15P59190 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB15P59190 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB15P59190 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB15P59190 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB15P59190 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB15P59190 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB15P59190 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB15P59190 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB15P59190 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB15P59190 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB15P59190 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB15P59190 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB15P59190 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB15P59190 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB15P59190 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB15P59190 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB15P59190 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB15P59190 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB15P59190 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB15P59190 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB15P59190 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB15P59190 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB15P59190 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB15P59190 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB15P59190 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB15P59190 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB15P59190 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB15P59190 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB15P59190 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB15P59190 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB15P59190 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB15P59190 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB15P59190 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB15P59190 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB15P59190 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB15P59190 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB15P59190 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB15P59190 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB15P59190 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB15P59190 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB15P59190 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB15P59190 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB15P59190 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB15P59190 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB15P59190 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB15P59190 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB15P59190 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB15P59190 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB15P59190 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB15P59190 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB15P59190 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB15P59190 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB15P59190 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB15P59190 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB15P59190 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB15P59190 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB15P59190 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB15P59190 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB15P59190 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB15P59190 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB15P59190 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB15P59190 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB15P59190 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB15P59190 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB15P59190 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB15P59190 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB15P59190 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB15P59190 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB15P59190 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB15P59190 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB15P59190 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB15P59190 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB15P59190 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB15P59190 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB15P59190 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB15P59190 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB15P59190 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB15P59190 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB15P59190 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB15P59190 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB15P59190 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB15P59190 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB15P59190 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB15P59190 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB15P59190 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB15P59190 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB15P59190 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB15P59190 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB15P59190 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB15P59190 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB15P59190 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB15P59190 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB15P59190 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB15P59190 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB15P59190 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms