Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00310P59036 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms