Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIPPLY3P57055 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms