Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P54278 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P54278 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P54278 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P54278 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P54278 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P54278 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P54278 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P54278 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P54278 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P54278 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P54278 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P54278 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P54278 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P54278 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMS2P54278 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMS2P54278 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMS2P54278 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PMS2P54278 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMS2P54278 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMS2P54278 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMS2P54278 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMS2P54278 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P54278 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P54278 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P54278 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P54278 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P54278 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P54278 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P54278 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P54278 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P54278 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P54278 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P54278 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P54278 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P54278 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P54278 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P54278 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P54278 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P54278 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P54278 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P54278 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P54278 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P54278 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P54278 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P54278 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P54278 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P54278 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P54278 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P54278 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P54278 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P54278 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P54278 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P54278 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P54278 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P54278 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P54278 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P54278 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P54278 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMS2P54278 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMS2P54278 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMS2P54278 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMS2P54278 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMS2P54278 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMS2P54278 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMS2P54278 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMS2P54278 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMS2P54278 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMS2P54278 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMS2P54278 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PMS2P54278 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMS2P54278 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMS2P54278 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMS2P54278 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMS2P54278 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMS2P54278 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMS2P54278 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMS2P54278 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMS2P54278 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMS2P54278 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS2P54278 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS2P54278 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS2P54278 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS2P54278 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS2P54278 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS2P54278 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS2P54278 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS2P54278 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS2P54278 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS2P54278 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS2P54278 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS2P54278 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS2P54278 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS2P54278 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS2P54278 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS2P54278 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS2P54278 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS2P54278 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS2P54278 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS2P54278 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms