Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1DP48730 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1DP48730 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms