Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VHLP40337 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VHLP40337 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VHLP40337 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VHLP40337 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VHLP40337 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VHLP40337 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VHLP40337 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VHLP40337 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VHLP40337 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VHLP40337 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VHLP40337 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VHLP40337 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VHLP40337 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VHLP40337 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VHLP40337 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VHLP40337 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VHLP40337 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VHLP40337 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VHLP40337 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VHLP40337 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VHLP40337 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VHLP40337 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VHLP40337 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VHLP40337 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VHLP40337 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VHLP40337 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VHLP40337 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VHLP40337 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VHLP40337 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VHLP40337 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VHLP40337 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VHLP40337 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VHLP40337 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VHLP40337 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VHLP40337 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VHLP40337 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
VHLP40337 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
VHLP40337 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VHLP40337 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VHLP40337 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VHLP40337 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VHLP40337 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VHLP40337 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VHLP40337 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VHLP40337 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
VHLP40337 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VHLP40337 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VHLP40337 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VHLP40337 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VHLP40337 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VHLP40337 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
VHLP40337 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VHLP40337 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VHLP40337 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VHLP40337 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VHLP40337 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VHLP40337 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VHLP40337 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VHLP40337 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VHLP40337 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VHLP40337 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VHLP40337 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VHLP40337 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VHLP40337 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VHLP40337 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VHLP40337 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VHLP40337 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VHLP40337 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VHLP40337 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VHLP40337 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VHLP40337 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VHLP40337 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VHLP40337 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VHLP40337 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VHLP40337 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VHLP40337 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VHLP40337 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
VHLP40337 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VHLP40337 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VHLP40337 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VHLP40337 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VHLP40337 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VHLP40337 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VHLP40337 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VHLP40337 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VHLP40337 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VHLP40337 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VHLP40337 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VHLP40337 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VHLP40337 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VHLP40337 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VHLP40337 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VHLP40337 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VHLP40337 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VHLP40337 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VHLP40337 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VHLP40337 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VHLP40337 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VHLP40337 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms