Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTRLP40313 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTRLP40313 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTRLP40313 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTRLP40313 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTRLP40313 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTRLP40313 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTRLP40313 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTRLP40313 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTRLP40313 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTRLP40313 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTRLP40313 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTRLP40313 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTRLP40313 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTRLP40313 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTRLP40313 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTRLP40313 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTRLP40313 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTRLP40313 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTRLP40313 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTRLP40313 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTRLP40313 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTRLP40313 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTRLP40313 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTRLP40313 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTRLP40313 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTRLP40313 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTRLP40313 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTRLP40313 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTRLP40313 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTRLP40313 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTRLP40313 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTRLP40313 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTRLP40313 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTRLP40313 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTRLP40313 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTRLP40313 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTRLP40313 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTRLP40313 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTRLP40313 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTRLP40313 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTRLP40313 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTRLP40313 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTRLP40313 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTRLP40313 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTRLP40313 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTRLP40313 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTRLP40313 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CTRLP40313 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTRLP40313 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTRLP40313 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CTRLP40313 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTRLP40313 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CTRLP40313 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTRLP40313 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTRLP40313 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTRLP40313 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRLP40313 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRLP40313 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRLP40313 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRLP40313 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRLP40313 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRLP40313 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRLP40313 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRLP40313 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRLP40313 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRLP40313 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRLP40313 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRLP40313 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRLP40313 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRLP40313 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRLP40313 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRLP40313 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRLP40313 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRLP40313 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRLP40313 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRLP40313 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRLP40313 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRLP40313 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRLP40313 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRLP40313 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRLP40313 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRLP40313 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRLP40313 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRLP40313 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRLP40313 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRLP40313 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRLP40313 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRLP40313 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRLP40313 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRLP40313 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRLP40313 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRLP40313 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRLP40313 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRLP40313 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRLP40313 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRLP40313 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRLP40313 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRLP40313 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTRLP40313 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 341.6 ms