Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRS3P32247 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRS3P32247 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRS3P32247 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRS3P32247 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRS3P32247 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRS3P32247 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRS3P32247 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRS3P32247 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRS3P32247 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BRS3P32247 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRS3P32247 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRS3P32247 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRS3P32247 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRS3P32247 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRS3P32247 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRS3P32247 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRS3P32247 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRS3P32247 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRS3P32247 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BRS3P32247 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRS3P32247 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRS3P32247 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRS3P32247 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRS3P32247 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRS3P32247 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRS3P32247 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRS3P32247 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRS3P32247 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRS3P32247 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRS3P32247 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRS3P32247 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRS3P32247 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRS3P32247 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRS3P32247 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRS3P32247 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRS3P32247 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRS3P32247 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRS3P32247 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRS3P32247 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRS3P32247 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRS3P32247 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRS3P32247 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRS3P32247 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRS3P32247 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRS3P32247 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRS3P32247 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRS3P32247 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRS3P32247 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRS3P32247 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRS3P32247 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRS3P32247 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRS3P32247 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRS3P32247 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRS3P32247 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRS3P32247 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRS3P32247 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRS3P32247 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRS3P32247 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRS3P32247 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRS3P32247 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRS3P32247 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRS3P32247 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRS3P32247 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRS3P32247 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRS3P32247 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRS3P32247 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRS3P32247 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRS3P32247 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRS3P32247 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRS3P32247 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BRS3P32247 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRS3P32247 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BRS3P32247 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRS3P32247 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRS3P32247 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRS3P32247 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRS3P32247 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRS3P32247 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRS3P32247 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRS3P32247 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRS3P32247 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRS3P32247 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRS3P32247 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRS3P32247 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRS3P32247 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRS3P32247 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRS3P32247 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRS3P32247 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRS3P32247 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRS3P32247 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRS3P32247 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRS3P32247 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRS3P32247 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRS3P32247 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRS3P32247 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRS3P32247 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRS3P32247 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRS3P32247 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRS3P32247 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms