Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP100P23497 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP100P23497 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP100P23497 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP100P23497 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP100P23497 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP100P23497 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP100P23497 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP100P23497 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP100P23497 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP100P23497 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP100P23497 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP100P23497 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SP100P23497 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SP100P23497 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP100P23497 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP100P23497 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP100P23497 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP100P23497 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP100P23497 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP100P23497 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP100P23497 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP100P23497 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP100P23497 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP100P23497 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP100P23497 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP100P23497 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP100P23497 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SP100P23497 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP100P23497 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP100P23497 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP100P23497 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP100P23497 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP100P23497 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP100P23497 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP100P23497 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP100P23497 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SP100P23497 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP100P23497 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP100P23497 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP100P23497 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP100P23497 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP100P23497 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP100P23497 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP100P23497 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP100P23497 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP100P23497 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SP100P23497 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP100P23497 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP100P23497 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP100P23497 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP100P23497 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SP100P23497 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP100P23497 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP100P23497 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP100P23497 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP100P23497 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP100P23497 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP100P23497 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP100P23497 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP100P23497 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP100P23497 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP100P23497 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SP100P23497 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP100P23497 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP100P23497 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP100P23497 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP100P23497 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP100P23497 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP100P23497 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP100P23497 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP100P23497 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP100P23497 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP100P23497 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP100P23497 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP100P23497 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP100P23497 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP100P23497 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP100P23497 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP100P23497 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP100P23497 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SP100P23497 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP100P23497 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP100P23497 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SP100P23497 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP100P23497 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP100P23497 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP100P23497 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP100P23497 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP100P23497 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP100P23497 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP100P23497 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP100P23497 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP100P23497 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP100P23497 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP100P23497 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP100P23497 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP100P23497 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP100P23497 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP100P23497 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms