Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2BP0DI82 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2BP0DI82 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2BP0DI82 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2BP0DI82 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2BP0DI82 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2BP0DI82 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2BP0DI82 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2BP0DI82 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2BP0DI82 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2BP0DI82 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2BP0DI82 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2BP0DI82 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2BP0DI82 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2BP0DI82 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2BP0DI82 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC2BP0DI82 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC2BP0DI82 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC2BP0DI82 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC2BP0DI82 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC2BP0DI82 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAPPC2BP0DI82 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC2BP0DI82 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms