Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXB5P09067 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB5P09067 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms