Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A1P02730 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms