Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP29O95721 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP29O95721 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP29O95721 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP29O95721 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP29O95721 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP29O95721 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP29O95721 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP29O95721 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP29O95721 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNAP29O95721 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNAP29O95721 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNAP29O95721 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNAP29O95721 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNAP29O95721 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAP29O95721 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms