Protein–RNA interactions for Protein: O75530

EED, Polycomb protein EED, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEDO75530 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEDO75530 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EEDO75530 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEDO75530 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEDO75530 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEDO75530 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEDO75530 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEDO75530 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EEDO75530 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EEDO75530 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEDO75530 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEDO75530 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEDO75530 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEDO75530 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEDO75530 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEDO75530 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEDO75530 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEDO75530 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEDO75530 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEDO75530 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEDO75530 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEDO75530 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEDO75530 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEDO75530 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEDO75530 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEDO75530 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEDO75530 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEDO75530 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEDO75530 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEDO75530 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEDO75530 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEDO75530 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEDO75530 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEDO75530 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEDO75530 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEDO75530 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEDO75530 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEDO75530 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEDO75530 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEDO75530 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEDO75530 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EEDO75530 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEDO75530 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEDO75530 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEDO75530 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEDO75530 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEDO75530 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEDO75530 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEDO75530 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEDO75530 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEDO75530 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEDO75530 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEDO75530 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEDO75530 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEDO75530 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEDO75530 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEDO75530 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEDO75530 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EEDO75530 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEDO75530 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEDO75530 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEDO75530 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEDO75530 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEDO75530 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEDO75530 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEDO75530 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEDO75530 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEDO75530 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEDO75530 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEDO75530 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEDO75530 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEDO75530 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEDO75530 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEDO75530 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEDO75530 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEDO75530 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEDO75530 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEDO75530 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEDO75530 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEDO75530 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEDO75530 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEDO75530 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEDO75530 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEDO75530 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEDO75530 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEDO75530 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEDO75530 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEDO75530 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEDO75530 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEDO75530 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEDO75530 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEDO75530 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEDO75530 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEDO75530 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEDO75530 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEDO75530 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEDO75530 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEDO75530 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEDO75530 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEDO75530 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms