Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNAB3O43448 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms