Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms