Protein–RNA interactions for Protein: O15067

PFAS, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFASO15067 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFASO15067 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFASO15067 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFASO15067 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFASO15067 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFASO15067 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFASO15067 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFASO15067 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFASO15067 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PFASO15067 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFASO15067 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFASO15067 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFASO15067 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PFASO15067 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFASO15067 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFASO15067 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFASO15067 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFASO15067 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFASO15067 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFASO15067 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFASO15067 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFASO15067 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFASO15067 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFASO15067 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFASO15067 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFASO15067 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFASO15067 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFASO15067 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFASO15067 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFASO15067 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFASO15067 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFASO15067 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFASO15067 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFASO15067 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PFASO15067 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFASO15067 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PFASO15067 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PFASO15067 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PFASO15067 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PFASO15067 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFASO15067 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFASO15067 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFASO15067 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFASO15067 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFASO15067 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFASO15067 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFASO15067 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFASO15067 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFASO15067 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFASO15067 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFASO15067 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFASO15067 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFASO15067 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFASO15067 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFASO15067 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFASO15067 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFASO15067 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFASO15067 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFASO15067 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFASO15067 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFASO15067 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PFASO15067 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFASO15067 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFASO15067 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFASO15067 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFASO15067 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFASO15067 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFASO15067 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFASO15067 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFASO15067 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFASO15067 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFASO15067 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PFASO15067 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFASO15067 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PFASO15067 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFASO15067 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFASO15067 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PFASO15067 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFASO15067 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFASO15067 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFASO15067 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFASO15067 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFASO15067 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFASO15067 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFASO15067 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFASO15067 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFASO15067 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFASO15067 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFASO15067 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFASO15067 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFASO15067 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFASO15067 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFASO15067 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFASO15067 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFASO15067 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFASO15067 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFASO15067 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PFASO15067 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PFASO15067 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PFASO15067 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms