Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIP1O00291 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIP1O00291 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIP1O00291 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIP1O00291 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIP1O00291 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIP1O00291 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIP1O00291 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIP1O00291 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIP1O00291 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIP1O00291 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIP1O00291 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIP1O00291 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIP1O00291 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIP1O00291 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIP1O00291 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIP1O00291 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIP1O00291 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIP1O00291 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIP1O00291 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIP1O00291 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIP1O00291 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIP1O00291 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIP1O00291 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIP1O00291 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIP1O00291 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIP1O00291 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIP1O00291 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIP1O00291 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIP1O00291 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIP1O00291 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIP1O00291 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIP1O00291 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIP1O00291 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIP1O00291 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIP1O00291 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIP1O00291 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HIP1O00291 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIP1O00291 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HIP1O00291 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIP1O00291 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIP1O00291 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIP1O00291 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIP1O00291 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIP1O00291 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIP1O00291 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIP1O00291 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIP1O00291 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIP1O00291 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIP1O00291 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIP1O00291 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIP1O00291 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIP1O00291 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIP1O00291 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIP1O00291 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIP1O00291 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIP1O00291 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIP1O00291 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIP1O00291 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HIP1O00291 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HIP1O00291 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HIP1O00291 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HIP1O00291 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HIP1O00291 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HIP1O00291 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
HIP1O00291 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HIP1O00291 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HIP1O00291 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIP1O00291 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HIP1O00291 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIP1O00291 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIP1O00291 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIP1O00291 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIP1O00291 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIP1O00291 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIP1O00291 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIP1O00291 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIP1O00291 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIP1O00291 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIP1O00291 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIP1O00291 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIP1O00291 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIP1O00291 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HIP1O00291 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HIP1O00291 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIP1O00291 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIP1O00291 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIP1O00291 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HIP1O00291 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIP1O00291 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HIP1O00291 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIP1O00291 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIP1O00291 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIP1O00291 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIP1O00291 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIP1O00291 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HIP1O00291 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIP1O00291 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HIP1O00291 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIP1O00291 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms