Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PBE3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PBE3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PBE3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PBE3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PBE3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PBE3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PBE3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PBE3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PBE3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PBE3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PBE3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PBE3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PBE3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PBE3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PBE3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PBE3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PBE3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PBE3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PBE3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PBE3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PBE3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PBE3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E9PBE3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
E9PBE3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
E9PBE3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E9PBE3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
E9PBE3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E9PBE3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PBE3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PBE3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PBE3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PBE3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PBE3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PBE3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PBE3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PBE3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PBE3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.32■■□□□ 1
E9PBE3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PBE3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PBE3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PBE3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PBE3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PBE3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PBE3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PBE3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PBE3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PBE3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PBE3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PBE3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PBE3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PBE3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PBE3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PBE3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PBE3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PBE3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PBE3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PBE3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PBE3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PBE3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PBE3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PBE3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.3■■□□□ 1
E9PBE3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PBE3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PBE3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PBE3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PBE3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PBE3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PBE3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PBE3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PBE3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PBE3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PBE3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
E9PBE3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PBE3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PBE3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PBE3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PBE3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PBE3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PBE3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PBE3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PBE3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PBE3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PBE3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PBE3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.28■■□□□ 1
E9PBE3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PBE3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PBE3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PBE3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PBE3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PBE3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PBE3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PBE3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PBE3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.27■■□□□ 1
E9PBE3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.27■■□□□ 1
E9PBE3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PBE3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PBE3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PBE3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
E9PBE3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms