Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms