Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 XRRA1-201ENST00000321448 4695 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CYLD-214ENST00000569418 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ZKSCAN3-201ENST00000252211 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TP53TG3B-201ENST00000341305 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PRKAG1-201ENST00000316299 1683 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PPP3CB-204ENST00000394829 3149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 GOLGA8CP-201ENST00000446144 5237 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 GOLGA8F-201ENST00000526619 5237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PAFAH1B2-204ENST00000527958 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 C19orf47-208ENST00000582783 3628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 WT1-AS-201ENST00000395900 3828 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 MPP4-208ENST00000447335 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CETP-202ENST00000379780 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 IMPDH1P8-201ENST00000413639 1525 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CSPG4P12-201ENST00000558282 4853 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC009093.9-201ENST00000566038 1611 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PLEKHG6-204ENST00000449001 3111 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ISL1-201ENST00000230658 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 KIR3DL1-201ENST00000326542 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SPRY4-201ENST00000344120 4938 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 OTOG-202ENST00000399391 8778 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC018521.1-202ENST00000641877 2655 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 DOCK10-201ENST00000258390 7260 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SLIT2-201ENST00000273739 5132 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 STAT6-203ENST00000537215 2886 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 MASTL-201ENST00000342386 2968 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 LUCAT1-201ENST00000511918 828 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 MIR4527HG-201ENST00000586905 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TBC1D3P5-203ENST00000586223 3083 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ANKRD13A-201ENST00000261739 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CDC14A-201ENST00000336454 4137 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AP002754.1-201ENST00000506329 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TTYH2-201ENST00000269346 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PCDHGA7-201ENST00000518325 4605 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 FAM49B-215ENST00000519824 3798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 HOPX-211ENST00000554144 1672 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 VIPAS39-206ENST00000553888 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ATCAY-205ENST00000600960 2904 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ERBB2-203ENST00000445658 3238 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 RASGEF1A-203ENST00000395809 4104 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CDKL2-201ENST00000307465 2565 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ST5-230ENST00000530438 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CHMP3-201ENST00000263856 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 LRSAM1-202ENST00000323301 3376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 XIRP1-202ENST00000396251 6040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 FAM86C2P-205ENST00000531806 1814 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 OLFML2A-201ENST00000288815 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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