Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms