Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCL2Q9UBD3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms