Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCNIP1Q9NZI2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms