Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCUBE2Q9NQ36 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCUBE2Q9NQ36 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms