Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED4Q9NPJ6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms