Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMURF1Q9HCE7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMURF1Q9HCE7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms