Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM79Q9BSE2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms