Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC22CQ9BRL7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC22CQ9BRL7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms