Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TEFMQ96QE5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TEFMQ96QE5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.1 ms