Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms