Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1CQ8NER5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1CQ8NER5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1CQ8NER5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1CQ8NER5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1CQ8NER5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1CQ8NER5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1CQ8NER5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1CQ8NER5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1CQ8NER5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1CQ8NER5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms