Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8G6

C15orf54, Putative uncharacterized protein C15orf54, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf54Q8N8G6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C15orf54Q8N8G6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C15orf54Q8N8G6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms