Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT20Q8IY31 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms