Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK3

SFR1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFR1Q86XK3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFR1Q86XK3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFR1Q86XK3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms