Protein–RNA interactions for Protein: Q86U38

NOP9, Nucleolar protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP9Q86U38 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NOP9Q86U38 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOP9Q86U38 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms