Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX1Q5SQQ9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms