Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMGN3Q15651 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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