Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3A2Q15428 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3A2Q15428 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SF3A2Q15428 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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