Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNAB1Q14722 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms