Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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DNASE1L3Q13609 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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DNASE1L3Q13609 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNASE1L3Q13609 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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