Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
STX4Q12846 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
STX4Q12846 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
STX4Q12846 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
STX4Q12846 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
STX4Q12846 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
STX4Q12846 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
STX4Q12846 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
STX4Q12846 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
STX4Q12846 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
STX4Q12846 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
STX4Q12846 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
STX4Q12846 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
STX4Q12846 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
STX4Q12846 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
STX4Q12846 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
STX4Q12846 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
STX4Q12846 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
STX4Q12846 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
STX4Q12846 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
STX4Q12846 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
STX4Q12846 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
STX4Q12846 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
STX4Q12846 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
STX4Q12846 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
STX4Q12846 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
STX4Q12846 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
STX4Q12846 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
STX4Q12846 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
STX4Q12846 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
STX4Q12846 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
STX4Q12846 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
STX4Q12846 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
STX4Q12846 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
STX4Q12846 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
STX4Q12846 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
STX4Q12846 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
STX4Q12846 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
STX4Q12846 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
STX4Q12846 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
STX4Q12846 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
STX4Q12846 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
STX4Q12846 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
STX4Q12846 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
STX4Q12846 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
STX4Q12846 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
STX4Q12846 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
STX4Q12846 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
STX4Q12846 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
STX4Q12846 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
STX4Q12846 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
STX4Q12846 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
STX4Q12846 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
STX4Q12846 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
STX4Q12846 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
STX4Q12846 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
STX4Q12846 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
STX4Q12846 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
STX4Q12846 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
STX4Q12846 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
STX4Q12846 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
STX4Q12846 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
STX4Q12846 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
STX4Q12846 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
STX4Q12846 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
STX4Q12846 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
STX4Q12846 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
STX4Q12846 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
STX4Q12846 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
STX4Q12846 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
STX4Q12846 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
STX4Q12846 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
STX4Q12846 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
STX4Q12846 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
STX4Q12846 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
STX4Q12846 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
STX4Q12846 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
STX4Q12846 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
STX4Q12846 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
STX4Q12846 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
STX4Q12846 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
STX4Q12846 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
STX4Q12846 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
STX4Q12846 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
STX4Q12846 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
STX4Q12846 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
STX4Q12846 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
STX4Q12846 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
STX4Q12846 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
STX4Q12846 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
STX4Q12846 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
STX4Q12846 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
STX4Q12846 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
STX4Q12846 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
STX4Q12846 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
STX4Q12846 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
STX4Q12846 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
STX4Q12846 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
STX4Q12846 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
STX4Q12846 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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