Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms