Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RELAQ04206 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RELAQ04206 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RELAQ04206 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RELAQ04206 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RELAQ04206 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RELAQ04206 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RELAQ04206 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RELAQ04206 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RELAQ04206 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RELAQ04206 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RELAQ04206 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RELAQ04206 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RELAQ04206 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RELAQ04206 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RELAQ04206 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RELAQ04206 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RELAQ04206 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RELAQ04206 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RELAQ04206 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RELAQ04206 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RELAQ04206 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RELAQ04206 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RELAQ04206 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RELAQ04206 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RELAQ04206 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RELAQ04206 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RELAQ04206 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RELAQ04206 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RELAQ04206 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RELAQ04206 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RELAQ04206 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RELAQ04206 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RELAQ04206 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RELAQ04206 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RELAQ04206 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RELAQ04206 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RELAQ04206 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RELAQ04206 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RELAQ04206 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RELAQ04206 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RELAQ04206 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RELAQ04206 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RELAQ04206 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RELAQ04206 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RELAQ04206 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RELAQ04206 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RELAQ04206 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RELAQ04206 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RELAQ04206 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RELAQ04206 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RELAQ04206 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RELAQ04206 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RELAQ04206 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RELAQ04206 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RELAQ04206 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RELAQ04206 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RELAQ04206 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RELAQ04206 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RELAQ04206 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RELAQ04206 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RELAQ04206 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RELAQ04206 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RELAQ04206 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RELAQ04206 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RELAQ04206 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RELAQ04206 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RELAQ04206 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RELAQ04206 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RELAQ04206 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RELAQ04206 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RELAQ04206 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RELAQ04206 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RELAQ04206 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RELAQ04206 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RELAQ04206 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RELAQ04206 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RELAQ04206 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RELAQ04206 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RELAQ04206 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RELAQ04206 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RELAQ04206 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RELAQ04206 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RELAQ04206 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RELAQ04206 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RELAQ04206 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RELAQ04206 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RELAQ04206 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RELAQ04206 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RELAQ04206 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RELAQ04206 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RELAQ04206 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RELAQ04206 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RELAQ04206 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RELAQ04206 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RELAQ04206 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RELAQ04206 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELAQ04206 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELAQ04206 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RELAQ04206 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms